Orientation bibliographique en microbiologie

Introduction

Cette page n'a ni la prétention ni pour objet de proposer une liste exhaustive des références relatives à la microbiologie, une telle entreprise serait, bien entendu, sans fin... Son ambition est de présenter une liste d'ouvrages, de publications ou de sites internet reconnus par la communauté scientifique comme incontournables ou majeurs, qu'ils soient généraux ou plus ciblés. Pour les sujets comportant une liste de références trop importante, se reporter aux éventuelles sous-pages plus spécialisées via les liens proposés. Le second objectif de cette page est, pour chaque groupe, d'en présenter les grandes lignes historiques de la littérature ainsi que d'en citer les auteurs ayant le plus de notoriété. Pour des références se rapportant plus spécifiquement à l'évolution, consulter la page Orientation bibliographique sur l'origine et l'évolution du vivant.


REFERENCE :         Référence scientifique majeure     -        Vulgarisation particulièrement excellente


Escherichia coli (Proteobacteria, Enterobacteriaceae)
Foraminifères benthiques. Dans le sens des aiguilles d'une montre depuis en-haut à gauche : Ammonia beccarii, Elphidium excavatum clavatum, Buccella frigida, et Eggerella advena (Foraminifera)
Isotricha intestinalis (Ciliata)
Diatomées marines
Plasmodium sp. (Plasmodiidae), agent du paludisme

Microbiologie générale

Bibliographie

  • John P.Harley, Donald A. Klein, Lansing M. Prescott, Linda M. Sherwood, Joanne M. Willey, Christopher J. Woolverton 2003. Microbiologie. De Boeck (ed).
  • Madigan M.T. and Martinko J.M., 2001. Brock Biology of Microorganisms. Prentice Hall (ed).
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Microbiologie médicale

Bibliographie

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Biologie et biochimie microbienne

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Références par groupes

Eubacteria

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Archaea

Bibliographie

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Eukaryotes unicellulaires (en général)

Bibliographie

  • Patterson, D., 1996. Free-Living Freshwater Protozoa : A Colour Guide. ASM Press (ed.).
  • Puytorac (de), P., Grain, J., Mignot, J.P., 2006. Précis de protistologie. Lubrecht & Cramer Ltd (éd.). 581 p. (ISBN 2850040495 et 978-2850040498).
  • Minchin, E.A., 1912. An introduction to the study of the Protozoa. London, E. Arnold (ed.).
  • Kudo, R.R., 1954. Protozoology. Springfield, Illinois, C. C. Thomas (publisher).
  • Treatise on Invertebrate Paleontology. The Geological Society of America & The University of Kansas. Boulder, Colorado & Lawrence, Kansas.
    • Kaesler, R. L., ed. Part B, Protista 1, vol. 1: Charophyta. 2005.
    • Selden, P.A., ed. Part B, Protista 1, vol. 2: Chrysomonadida, Coccolithophorida, Charophyta, Diatomacea & Pyrrhophyta. In preparation.
    • Moore, R.C., ed. Part C, Protista 2, vol. 1 & 2: Sarcodina, Chiefly “Thecamoebians” and Foraminiferida. 1964.
    • Moore, R.C., ed. Part D, Protista 3: Protozoa (Chiefly Radiolaria and Tintinnina). 1954.
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Micro*Scope est la source d'images de protistes la plus riche à l'heure actuelle.

Algues unicellulaires

Algaebase représente aujourd'hui LA référence en matière de taxonomie des microalgues.




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Alveolata

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Ciliata

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Dinoflagellata

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Apicomplexa

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Chromista

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Oomycota

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Bacillariophyta

Bibliographie

  • Loir, M., 2004. Guide des diatomées. Delachaux et Niestlé (éd.).
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Cryptophyta

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Haptophyta

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Rhizaria

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Actinopoda - Acantharea

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Actinopoda - Heliozoa

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Actinopoda - Radiolaria

Bibliographie

  • Bykhovsky, B.E., 1971. Radiolaria of the World Ocean. Pensoft (ed.), 420 pp. (en russe)
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Foraminifera

Bibliographie

  • Sen Gupta, B.K., 1999, 2002. Modern Foraminifera. Kluwer Academic Publishers (ed.), 371 pp. (ISBN 0412824302) (1999); (ISBN 1402005989) (2002).
  • Murray, J., 2006. Ecology and Applications of Benthic Foraminifera. Cambridge University Press (ed.), 426 pp. (ISBN 0521828392).

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Chlorarachniophyta

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Excavata

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Euglenozoa

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Parabasalia

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Metamonada

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Percolozoa

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Glaucophyta

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Amoebozoa

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Rhizopoda

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Mycetozoa

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Mycota

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Microsporidia

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Choanoflagellata

Bibliographie

  • Leadbeater, B., Thomsen, H., 2000. Order choanoflagellida. In « An Illustrated Guide to the Protozoa », by Leadbeater, B. and Thomsen, H. Society of Protozoologists, Lawrence (ed.), 14-38.
  • Leadbeater, B., Kelly, M., 2001. Evolution of animals choanoflagellates and sponges. Water and Atmosphere Online, 9 (2) : 9-11.
  • Nerad, A., Daggett, P., 1992. Cultivation of Choanoflagellates. In « Protocols In Protozoology », by Nerad, A. and Daggett, P. Society of Protozoologists, Lawrence (ed.), A-20.1-A-20.4.

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Virus

Bibliographie

  • Boyer, M., Yutin, N., Pagnier, I., Barrassi, L., Fournous, G., Espinosa, L., Robert, C., Azza, S., Sun, S., Rossmann, M.G., Suzan-Monti, M., La Scola, B., Koonin, E.V., Raoult, D. : Giant Marseillevirus highlights the role of amoebae as a melting pot in emergence of chimeric microorganisms. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009 (pdf)
  • Raoult, D., 2006. Mimivirus : le plus gros des virus. Pour la Science, , p54-59.
  • Pierre Ardoin : Virus et diagnostic virologique. Paris, Maloine Éditeur, 1983, 997p.
  • Thierry Borrel : Les Virus. Diversité et organisation du monde viral. Interactions avec le vivant. Nathan Université, Paris, 1996.
  • Gessain A., Manuguerra J.C. : Les virus émergents. Collection « Que sais-je ? », Presses Universitaires de France, 2006.

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Références par zone géographiques

Europe

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Régions polaires

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Écologie microbienne générale

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Eaux douces

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Milieu océanique

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Plancton

Bibliographie

  • C. S. Reynolds, 2006. The Ecology of Phytoplankton (Ecology, Biodiversity and Conservation). Cambridge University Press (May 29, 2006), 550 pp. (ISBN 0521605199 et 978-0521605199).
  • Tomas, C. (ed.), 1997, Identifying Marine Phytoplankton, Academic Press, San Diego
  • Horner, R.A., 2002, A taxonomic guide to some common marine phytoplankton, Biopress limited

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Extrêmophiles

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